人工智能助力病原精准诊断

中国医药报发文

2022年1月28日，中国食品药品检定研究院的刘东来、王浩、李佳戈、许四宏等学者在中国医药报发表了《赋能宏基因组测序技术 助力精准病原学诊断—浅谈人工智能在病原微生物鉴定及其耐药表型预测方面的应用》文章，就人工智能，宏基因组测序，病原精准诊断展开讨论。

文章概要

宏基因组测序技术临床价值突出

病原宏基因组高通量测序技术，因具有无需对病原体进行分离培养、检测范围广、无需靶向扩增、灵敏度高等特点，可一次性直接对样本所包含所有微生物进行高精度、高维度分析研究。另外，宏基因组测序技术在个性化用药治疗方面同样具有重要的临床价值。基于宏基因组测序技术对病原微生物的耐药基因进行检测，再经过严格的生物信息分析流程，进一步预测该病原微生物的耐药表型，从而指导临床进行精准治疗。宏基因组测序技术是有望满足临床对感染性疾病诊疗“快速、准确、全面”需求的技术路线之一。

人工智能辅助整合临床信息，推动实现感染性疾病精准诊断

人工智能技术的应用可以对宏基因组测序数据与临床实验室的其他检测数据进行关联分析，从而有助于鉴别新型生物标志物、预测临床感染（如脓毒症等）的发生和预后，并辅助临床决策。持续优化人工智能系统，使其随数据更新不断进化，将能协助经验丰富的研究人员或临床医生制定个性化的精准诊疗方案。

人工智能辅助挖掘测序数据显著，提升耐药表型预测准确率

在病原微生物耐药表型预测方面，人工智能技术通过对测序数据深入挖掘，可以有效提升预测准确率。目前，已有研究使用了类似技术，对耐药基因开展表型预测，并达到了良好结果。例如，金匙医学科技有限公司等正在联合开发基于宏基因组测序技术的细菌耐药表型人工智能分析系统，在临床最为关注的鲍曼不动杆菌的耐药表型预测中，基于使用深度学习方法构建的模型，预测准确率可达到90%以上。